2015年，朋友派出的惡魔推銷員遍布世界各大主要城市，致命的病毒就此蔓延，全球愈20億人喪命。在此之后，朋友開發出的疫苗拯救無數絕望的生靈，他再次被人類奉為神明，朋友帝國的統治進一步加強。 與此同時，以義常（香川照之 飾）為首的“賢知一派”和神奈率領的“冰之女王軍”與朋友及其地球防衛軍接連展開對抗。在被高墻封閉起來的東京，朋友做出新的預言，“2017年8月20日這天，外星人將來到地球散播更為致命的病毒，全人類都會因此滅亡”。人類危在旦夕，革命軍加緊部署，阿區（豐川悅司 飾）、賢知（唐澤壽明 飾）、青蛙仔（宮迫博之 飾）、丸夫（石塚英彥 飾）也相繼回到這里。關系人類命運的最終決戰即將展開…… 本片根據浦澤直樹同名漫畫改編，影片簡介中涉及的人名均以原著漫畫中文版翻譯為準。
2000年血腥除夕夜，賢知（唐澤壽明 飾）一派拼盡全力阻撓“朋友”的人類滅絕計劃，但他們的反抗以失敗告終。是夜過后，賢知一派被誣為屠殺人類的恐怖分子，而“朋友”則堂而皇之成為了救世主，為萬眾膜拜和敬仰。 2015年，賢知的甥女遠藤神乃（平愛梨 飾）已成長為特立獨行的青春女孩，她十分反感教科書對舅舅的污蔑，經常和老師發生爭論。最終，校方決定將她和另一位曾對血腥除夕夜提出質疑的女孩小泉響子（木南晴夏 飾）送入“朋友樂園”。與此同時，曾在“朋友樂園”接受改造的異裝癖男子偶然得知“朋友”的秘密，被警方殺害。目睹這一幕的神乃決定進入“朋友樂園”一探究竟。 另一方面，新的萬國博覽會將在日本召開，羅馬教宗亦會在此時造訪日本。被關在螢火蟲集中營的阿區（豐川悅司 飾）越獄而出，賢知一派幸存的同志們紛紛聚首。在這個暗潮洶涌的時刻，人類的命運將再次改寫…… 本片根據浦澤直樹同名漫畫改編。 （影片簡介中涉及的人名均以原著漫畫中文版翻譯為準）
最強戰士貝利奧斯因為渴望人工太陽火炬的力量而墜入黑暗，但他的叛亂最終被奧特之王平定，并被打進宇宙監獄…… 多年以后，被扎布拉星人救出的貝利奧斯重回光之國，打敗了眾奧特戰士，成功奪走人工太陽火炬并到怪獸墓場去。失去了火炬的奧特之星瞬間凍結，成功逃離的就只有夢比優斯、初代和賽文。 此時，盤龍號在特頓星遭遇怪獸的襲擊。在雷將怪獸消滅后，夢比優斯把雷帶走，并向他求救。兩人與初代、塞文會合后，便一同前往怪獸墓場……其后，盤龍號再次遭受怪獸襲擊，而此次被戴拿出手相救。在杰頓星人口中得知奧特之星的災難后，盤龍號也飛往怪獸墓場…… 另一方面，在K76行星接受雷歐兄弟特訓的賽文之子·ZERO在聽聞奧特之星的危機后，也動身到怪獸墓場……
2010年秋，世衛組織官員小林榮子（檀麗 Rei Dan 飾）隨隊前往菲律賓撲滅禽流感，疫情很快得以控制，但仍有感染者私自離開疫區……次年，東京都的某家市立醫院，醫生松岡剛（妻夫木聰 Satoshi Tsumabuki 飾）收治的一名高燒病人入院后情況急轉直下，咳血而死，病人家屬與部分醫生亦因感染而病倒。同時，近郊一家養 雞場內檢測出禽流感病毒，場主神蒼及女兒（池肋千鶴 Chizuru Ikewaki 飾）的平靜生活被打破。 小林榮子受命至此指導防疫，舊相識松岡擔任其助手。疫情迅速擴散，一月之內病亡人數達到兩千，各地出現恐慌，引發國際關注，政府迅速將疫區封鎖。松岡偶然之下得知病毒源頭可能另有所在，國外傳回的檢測結果支持了他的判斷，松岡決定遠赴國外查找病源。在空前的疫情中，松岡、小林以及神蒼每個人都將面臨自己選擇的考驗。